La mécanique moléculaire

En mécanique moléculaire on considère une molécule comme un ensemble d'atomes reliés par les liaisons (liaisons chimique) et on calcule l'énergie d'interaction entre ces atomes en faisant la somme d'une série de fonctions de potentiel, d'où l'expression de "champ de force" , (ou force field en anglais) utilisée pour désigner ces méthodes de calcul.

Cette énergie se décompose donc en une somme de termes correspondants aux contributions d'interactions de types différents.

E_total = E_Elongation + E_{Déformation angulaire} + E_Torsion + E_{Déformation hors du plan} + E_{Electrostatique} + E_{Van der Walls} + E_{Liaison hydrogène} (Eq.01)

Les trois premiers termes correspondent à des interactions entre atomes liés, les trois derniers entre atomes non liés directement.

Chacun de ces termes a une valeur minimale pour une position particulière des atomes les uns par rapport aux autres qui peut être caractérisée les variables géométriques suivantes.

Les champs de force "classiques" se limitent à ces termes simples. Les champs de force dits "de deuxième génération" font intervenir des termes mixte permettant de prendre en compte l'interdépendance de ces divers types d'interactions.

Examinons successivement chacun de ces termes énergétiques pour les champs de force "classiques.