Parmi ces trois orbitales moléculaires, deux doivent représenter des modes de liaison (orbitales moléculaires liantes) car l'atome de Be doit être lié à deux atomes d'hydrogène.

En considérant que les différences de signes mathématiques peuvent être représentés par des couleurs différentes (par exemple rouge : positif et bleu : négatif), nous pouvons schématiser comme suit les orbitales moléculaires :

Dans Y3, nous avons clairement choisi « d'inverser » le signe de l'orbitale 2pz du Be tel qu'il aurait pu être anticipé au départ de telle façon à créer une orbitale moléculaire liante. Ce choix est compatible avec les orbitales moléculaires présentes dans BeH2 et cohérent avec les énergies données dans le tableau.