Les logiciels
Du coté logiciels on dispose de suites permettant de construire des modèles de simulation sans écrire une seule ligne de code. Ceci est vrai dans tous les domaines scientifiques et techniques et en particulier en modélisation moléculaire. De nombreux logiciels de modélisation "presse bouton" sont disponibles, que ce soit en free-ware ou commercialement. Il en résulte qu'il n'est pas nécessaire aujourd'hui d'être spécialiste en chimie théorique, ou même simplement bien au fait des méthodes de modélisation moléculaire, pour pouvoir appliquer ces méthodes à des problèmes de chimie ou de biochimie sur son ordinateur personnel.